| 排名 | 学校中文名 | 学校英文名 | 国家/地区 |
| 1 | 哈佛大学 | Harvard University | 美国 |
| 2 | 麻省理工学院 | Massachusetts Institute of Technology | 美国 |
| 3 | 斯坦福大学 | Stanford University | 美国 |
| 4 | 剑桥大学 | University of Cambridge | 英国 |
| 5 | 牛津大学 | University of Oxford | 英国 |
| 6 | 加州大学伯克利分校 | University of California, Berkeley | 美国 |
| 7 | 普林斯顿大学 | Princeton University | 美国 |
| 8 | 耶鲁大学 | Yale University | 美国 |
| 9 | 哥伦比亚大学 | Columbia University | 美国 |
| 10 | 加州理工学院 | California Institute of Technology | 美国 |
| 11 | 芝加哥大学 | University of Chicago | 美国 |
| 12 | 东京大学 | University of Tokyo | 日本 |
| 13 | 加州大学洛杉矶分校 | University of California, Los Angeles | 美国 |
| 14 | 密歇根大学安娜堡分校 | University of Michigan | 美国 |
| 15 | 帝国理工学院 | Imperial College London | 英国 |
| 16 | 宾夕法尼亚大学 | University of Pennsylvania | 美国 |
| 17 | 康奈尔大学 | Cornell University | 美国 |
| 18 | 清华大学 | Tsinghua University | 中国 |
| 19 | 苏黎世联邦理工学院 | ETH Zurich – Swiss Federal Institute of Technology Zurich | 瑞士 |
| 20 | 伦敦大学学院 | University College London | 英国 |
| 21 | 北京大学 | Peking University | 中国 |
| 22 | 约翰霍普金斯大学 | Johns Hopkins University | 美国 |
| 23 | 多伦多大学 | University of Toronto | 加拿大 |
| 24 | 伦敦政治经济学院 | London School of Economics and Political Science | 英国 |
| 25 | 纽约大学 | New York University | 美国 |
| 26 | 新加坡国立大学 | National University of Singapore | 新加坡 |
| 27 | 京都大学 | Kyoto University | 日本 |
| 28 | 杜克大学 | Duke University | 美国 |
| 29 | 华盛顿大学 | University of Washington | 美国 |
| 30 | 伊利诺伊大学厄本那-香槟分校 | University of Illinois at Urbana-Champaign | 美国 |
| 30 | 莫斯科国立大学 | Lomonosov Moscow State University | 俄罗斯 |
| 30 | 西北大学 | Northwestern University | 美国 |
| 33 | 卡耐基梅隆大学 | Carnegie Mellon University | 美国 |
| 34 | 德克萨斯大学奥斯汀分校 | University of Texas at Austin | 美国 |
| 35 | 威斯康辛大学麦迪逊分校 | University of Wisconsin-Madison | 美国 |
| 35 | 加州大学圣地亚哥分校 | University of California, San Diego | 美国 |
| 37 | 英属哥伦比亚大学 | University of British Columbia | 加拿大 |
| 38 | 爱丁堡大学 | University of Edinburgh | 英国 |
| 39 | 麦吉尔大学 | McGill University | 加拿大 |
| 40 | 佐治亚理工学院 | Georgia Institute of Technology | 美国 |
| 40 | 慕尼黑大学 | LMU Munich | 德国 |
| 42 | 加州大学旧金山分校 | University of California, San Francisco | 美国 |
| 43 | 伦敦大学国王学院 | King’s College London | 英国 |
| 44 | 宾州州立大学公园分校 | Pennsylvania State University | 美国 |
| 45 | 加州大学戴维斯分校 | University of California, Davis | 美国 |
| 45 | 香港大学 | University of Hong Kong | 香港 |
| 45 | 首尔国立大学 | Seoul National University | 韩国 |
| 48 | 洛桑联邦理工学院 | École Polytechnique Fédérale de Lausanne | 瑞士 |
| 49 | 曼彻斯特大学 | University of Manchester | 英国 |
| 49 | 墨尔本大学 | University of Melbourne | 澳大利亚 |
| 49 | 明尼苏达大学双城分校 | University of Minnesota | 美国 |
| 51-60 | 代尔夫特理工大学 | Delft University of Technology | 荷兰 |
| 51-60 | 海德堡大学 | Heidelberg University | 德国 |
| 51-60 | 柏林洪堡大学 | Humboldt University of Berlin | 德国 |
| 51-60 | 卡罗琳学院 | Karolinska Institute | 瑞典 |
| 51-60 | 马里兰大学学院公园分校 | University of Maryland, College Park | 美国 |
| 51-60 | 北卡罗来纳大学教堂山分校 | University of North Carolina at Chapel Hill | 美国 |
| 51-60 | 俄亥俄州立大学 | Ohio State University | 美国 |
| 51-60 | 大阪大学 | Osaka University | 日本 |
| 51-60 | 普渡大学西拉法叶分校 | Purdue University | 美国 |
| 51-60 | 慕尼黑工业大学 | Technical University of Munich | 德国 |
| 61-70 | 阿姆斯特丹大学 | University of Amsterdam | 荷兰 |
| 61-70 | 澳洲国立大学 | Australian National University | 澳大利亚 |
| 61-70 | 巴黎高等师范学院 | École Normale Supérieure | 法国 |
| 61-70 | 鲁汶大学（荷语） | KU Leuven | 比利时 |
| 61-70 | 密歇根州立大学 | Michigan State University | 美国 |
| 61-70 | 南加州大学 | University of Southern California | 美国 |
| 61-70 | 悉尼大学 | University of Sydney | 澳大利亚 |
| 61-70 | 东北大学（日本） | Tohoku University | 日本 |
| 61-70 | 圣路易斯华盛顿大学 | Washington University in St Louis | 美国 |
| 71-80 | 波士顿大学 | Boston University | 美国 |
| 71-80 | 布朗大学 | Brown University | 美国 |
| 71-80 | 加州大学圣塔芭芭拉分校 | University of California, Santa Barbara | 美国 |
| 71-80 | 香港中文大学 | Chinese University of Hong Kong | 香港 |
| 71-80 | 柏林自由大学 | Free University of Berlin | 德国 |
| 71-80 | 复旦大学 | Fudan University | 中国 |
| 71-80 | 香港科技大学 | Hong Kong University of Science and Technology | 香港 |
| 71-80 | 匹兹堡大学 | University of Pittsburgh | 美国 |
| 71-80 | 上海交通大学 | Shanghai Jiao Tong University | 中国 |
| 71-80 | 德州农工大学 | Texas A&M University | 美国 |
| 81-90 | 印第安纳大学伯明顿分校 | Indiana University (Bloomington) | 美国 |
| 81-90 | 韩国高等科技学院 | Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST) | 韩国 |
| 81-90 | 莱顿大学 | Leiden University | 荷兰 |
| 81-90 | 伦敦商学院 | London Business School | 英国 |
| 81-90 | 南洋理工大学 | Nanyang Technological University | 新加坡 |
| 81-90 | 国立台湾大学 | National Taiwan University | 台湾 |
| 81-90 | 巴黎第六大学 | Pierre and Marie Curie University | 法国 |
| 81-90 | 亚琛工业大学 | RWTH Aachen University | 德国 |
| 81-90 | 圣彼得堡国立大学 | Saint Petersburg State University | 俄罗斯 |
| 81-90 | 东京工业大学 | Tokyo Institute of Technology | 日本 |
| 81-90 | 华威大学 | University of Warwick | 英国 |
| 81-90 | 浙江大学 | Zhejiang University | 中国 |
| 91-100 | 亚利桑那州立大学 | Arizona State University | 美国 |
| 91-100 | 科罗拉多大学博尔德分校 | University of Colorado Boulder | 美国 |
| 91-100 | 巴黎高等理工学院 | École Polytechnique | 法国 |
| 91-100 | 欧洲工商管理学院 | Insead | 法国 |
| 91-100 | 隆德大学 | Lund University | 瑞典 |
| 91-100 | 莫斯科物理技术学院 | Moscow Institute of Physics and Technology | 俄罗斯 |
| 91-100 | 巴黎第一大学 | Panthéon-Sorbonne University – Paris 1 | 法国 |
| 91-100 | 圣保罗大学 | University of São Paulo | 巴西 |
| 91-100 | 乌得勒支大学 | Utrecht University | 荷兰 |
| 91-100 | 瓦格宁根大学 | Wageningen University and Research Center | 荷兰 |
参考资料：World Reputation Rankings 2016 Times Higher Education