注意事项：
（1）本文是美国本科阶段开设微生物学专业的学校列表，共统计有210所综合性大学、47所文理学院以及2所地方性大学。综合性大学包含USNEWS排名前200的所有学校外加10所USNEWS世界排名较高或各州的公立旗舰学校，文理学院统计的是USNEWS排名前50（3所军事院校除外）的学校，2所地方性大学分别为：纽约市立学院和克雷顿大学。未区分综合性大学和文理学院，则表示该专业未有文理学院开设。
（2）本文所示的本科综排为2015USNEWS美国综合性大学排名，世界排名为2015USNEWS世界大学排名美国国内排名；“-”代表该校未进入排名榜单
（3）“专业名称”和“专业英文名”为该校实际开设的专业名称——同一专业各个学校的叫法可能不同，也有部分学校会将多个专业组合在一起开设，形成组合学科，或交叉学科，因此同一个专业各个学校实际对应的专业项目名称是不尽相同的。
学校列表
| 综合排名 | 世界排名 | 学校名称 | 专业名称 | 专业英文名 |
| 20 | 3 | 加州大学伯克利分校 | 微生物学 | Microbial Biology |
| 23 | 8 | 加州大学洛杉矶分校 | 微生物学，免疫学与分子遗传学 | Microbiology, Immunology, and Molecular Genetics |
| 29 | 14 | 密歇根大学安娜堡分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 37 | 18 | 加州大学圣地亚哥分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 38 | 37 | 加州大学戴维斯分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 40 | 28 | 加州大学圣塔芭芭拉分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 42 | 66 | 加州大学尔湾分校 | 微生物学与免疫学 | Microbiology and Immunology* |
| 47 | 27 | 威斯康辛大学麦迪逊分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 48 | 14 | 华盛顿大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 48 | 53 | 佛罗里达大学 | 微生物与细胞科学 | Microbiology and Cell Science |
| 48 | 52 | 宾州州立大学公园分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 53 | 30 | 德克萨斯大学奥斯汀分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 62 | 51 | 马里兰大学学院公园分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 62 | 42 | 匹兹堡大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 62 | - | 克莱蒙森大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 62 | 205 | 佐治亚大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 62 | - | 杨百翰大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 62 | 69 | 普渡大学西拉法叶分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 68 | 86 | 德州农工大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 70 | 55 | 罗格斯大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 71 | 29 | 明尼苏达大学双城分校 | 微生物学 | microbiology |
| 71 | 121 | 爱荷华大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 76 | 114 | 印第安纳大学伯明顿分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 76 | - | 迈阿密大学（俄亥俄） | 微生物学 | Microbiology |
| 76 | 115 | 马萨诸塞大学阿默斯特分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 85 | 75 | 密歇根州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 85 | 484 | 佛蒙特大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 88 | 381 | 阿拉巴马大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 95 | 213 | 北卡罗来纳州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 99 | 253 | 内布拉斯加大学林肯分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 99 | - | 新罕布什尔大学 | 生物医学：微生物学 | Biomedical Science: Medical Microbiology |
| 103 | - | 奥本大学 | 微生物学 | Microbial, Cellular and Molecular Biology Microbiology Option (MCMB) |
| 106 | 208 | 堪萨斯大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 106 | 155 | 爱荷华州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 106 | 171 | 田纳西大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 106 | 284 | 俄克拉荷马大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 113 | 127 | 加州大学河滨分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 121 | 64 | 亚利桑那大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 121 | 241 | 科罗拉多州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 129 | 143 | 亚利桑那州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 129 | - | 路易斯安那州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 129 | - | 俄亥俄大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 138 | 250 | 俄勒冈州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 138 | 325 | 华盛顿州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 145 | 438 | 俄克拉荷马州立大学 | 微生物学 | Microbiology, Cell and Molecular Biology |
| 149 | 492 | 圣地亚哥州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 156 | - | 密西西比州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 156 | 438 | 德克萨斯理工大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 161 | 299 | 南佛罗里达大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 161 | - | 怀俄明大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 161 | - | 罗德岛大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 166 | - | 爱达荷大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 168 | - | 西弗吉尼亚大学 | 免疫学与医学微生物学 | Immunology and Medical Microbiology |
| 168 | 321 | 夏威夷大学马诺阿分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 173 | - | 缅因大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 173 | - | 波尔州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 173 | - | 博林格林州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 181 | - | 北达科他州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 181 | - | 南达科他州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 189 | - | 南伊利诺伊大学卡本代尔分校 | 微生物学 | Microbiology |
| 194 | - | 内华达大学雷诺分校 | 分子微生物学与免疫学 | Molecular Microbiology & Immunology |
| 194 | - | 蒙大拿大学 | 微生物学 | Microbiology |
| 194 | - | 中密歇根大学 | 微生物学 | Biology: Microscopy |
| RNP | - | 新墨西哥州立大学 | 微生物学 | Microbiology |
| RNP | - | 蒙大拿州立大学 | 微生物学 | Microbiology |